水稻分蘖期主要病害有：稻瘟病、稻纹枯病、稻黄叶矮缩病等；虫害有：钻心虫、稻飞虱等。所以要求农户在稻分蘖期必须搞好病虫害的防治。
    1、在稻田分蘖期若发现有叶稻瘟可在破口前2～3天，每亩用40%富士1号乳油75～100毫升或20%三环唑可湿性粉剂100克，加水50～75公斤喷雾，5 - 7天后根据天气情况再喷药一次。稻纹枯病对发病稻田，亩用5%井岗霉素水剂100毫升-150毫升，或井岗霉素高浓度粉剂25克，兑水100千克进行喷雾。
    2、在水稻分蘖期若发现有螟虫亩用25%杀虫双水剂150毫升-200毫升或25%杀虫双水剂100毫升加BT乳剂100毫升兑水60千克-75千克喷雾。稻飞虱应掌握小若虫高峰期进行喷药，喷药时要均匀周到，注意把药液喷在稻株的中、下部。药剂可使用扑虱灵可湿性粉剂20克-25克，或20%叶蝉散乳油150毫升，兑水75千克-100千克喷雾。稻纵卷叶螟亩可用25%杀虫双水剂150毫升-200毫升，或50%杀螟松乳油70毫升，兑水60千克-70千克喷雾，施药时间以傍晚为宜。