一、池内的发酵料液严重偏酸，虽产气，但甲烷含量少，致使所产气体不能使用，这种现象叫沼气池酸中毒。一般以兔粪作为原料的沼气池常出现酸中毒，因兔以青草和菜叶作饲料，兔粪呈酸性。　　
处理方法：从池内取1/3-1/2的老料，加入相适应的新料，并投入适量的澄清石灰水，搅拌均匀即可。　　
    二、是池内的发酵料液严重偏碱，不能正常产气，这叫沼气池碱中毒。主要是由于有的养猪户为了灭菌，在猪舍内撒入石灰水，使猪粪带碱入池引起的。 　　
处理办法：从池内取出一部分老料，加入一部分带酸性的料，如青草落叶，使pH值达到7。　　
    三、无公害厕所喷杀、灭虫不当，可能会引起沼气池药性中毒，停止产气。　　
    处理方法：从池内取出1/2的老料，加入等量的无害新料，并向池内放入清水，加入一些菌种，使其达到适宜的酸碱度。