危害甜椒的病虫害很多，主要有疫病、炭疽病、病毒病、青枯病、蚜虫、棉铃虫、烟青虫等。　　
    1、疫病：苗期每亩用百菌清烟雾剂　250克　熏蒸。中后期出现中心病株后，用50％甲霜铜可湿性粉剂800倍液或72.2％普力克水剂600-800倍液灌根。发病初期用杜邦克露可湿性粉剂600倍液喷雾。　　
    2、炭疽病：苗期发病，用45％百菌清烟雾剂　250克　熏蒸。发病初期用50％混合硫悬浮剂500倍液或炭疽福美可湿性粉剂600-800倍液喷雾。　　
    3、病毒病：早期防治蚜虫，用10％吡虫啉可湿性粉剂1500倍液喷雾。发病初期用20％病毒A400倍液+硫酸锌1000倍液+爱多收600倍液或用1.5％植病灵400倍液+1％硫酸锌溶液喷雾。　　
    4、青枯病：用14％络氨铜300倍液、77％可杀得可湿性粉剂500倍液或硫酸链霉素4000倍液喷雾。　　
    5、棉铃虫、烟青虫：用2％灭扫利乳油2000倍液或10％联苯菊酯乳油3000倍液喷雾。　　
    6、防治药害：如发生除草剂飘移药害，可以喷施植物生长促进剂（爱多收、阳光润农等）+50mg∕kg赤霉素加以缓解。