辣椒病毒病在苗期侵染辣椒，造成的损失最重；疫病的侵染时间较长，辣椒苗期、成株期都易侵染该病造成整株死亡，损失较大：旺长期易发生细菌性斑点病；盛果期易受白粉病侵染危害，造成中后期大量的落叶、落花、落果；挂果成熟期易发生炭疽病，造成大量烂果。辣椒5种主要病害只可防，不可治，应从预防手，进行系统防治，有针对性的采用“三药防五病”并兼治其它病害，才能取的　　
防效。　　
    (1)苗期预防辣椒病毒病。苗期由于苗床较集中，好管理，预防较省工、省力、省药，且防效好。黄瓜花叶病毒病 (C MV)由蚜虫传播，因此苗期视　　
    蚜虫的防治。在防治好传毒昆虫的基础上，从 5叶期开始用4 6％病毒清可溶粉剂 8 0 0倍液泼浇椒苗，间隔1 0—1 5天再泼浇1次，能有效地预防病毒病。移栽前2—5天喷淋1次7 0％黑胫清 5 0 0倍液，然后带药移栽，能很好的预防病、立枯病等，并能保证健苗移栽，减少该病传入大田造成大面积危害。　　
    (2)大田病害预防。根据大田期辣椒死苗的发生特点，应在移栽后3—5天浇1次7 0％黑胫清可湿性粉剂5 0 0倍液，每株5 0毫升，能有效预防死苗，历病连作田，间隔1 0，1 5天要再施用1次。旺长期叶面喷雾1次4 6％病毒清8 00倍液，可有效预防病毒病芹。缺素症：初果期初见细菌性斑点病或白粉病斑时．应及时用5 5％锦田可湿性粉剂 5 0 0倍液进行叶面、叶背(白粉病着重喷叶背)雾能有效地防治细菌性斑点病、白粉病和炭疽病。重病田或大棚，间隔1 0天喷1次，连续应用2—3次。能有效地减少辣椒病害造成的损失。以上3种药剂不能混用，与其它药剂及叶面肥也不能混用，每种药剂的施用间隔期为5—7天，提高防治效果。