一、免疫抑制病的干扰
    免疫抑制病可导致疫苗免疫失败或误诊。若对呼吸道病的临床诊治单纯地对症治疗，只能一时控制症状，不能彻底治愈。有时因免疫抑制病的发生，使诊断和治疗步入误区，治疗效果不明显。频繁用药、频繁换药、超剂量用药导致久治不愈，还引发鸡的药源性肝肾肿大。
    在肉鸡养殖密集区，鸡呼吸道病患病原因有非典型新城疫、通风不良等，鸡群虽在7日龄、21日龄两次免疫新城疫，但仍发生新城疫，并有气囊炎、支气管堵塞等继发病症。
    二、技术员水平不够
    鸡呼吸道病难治和禽流感的误判。部分技术人员对呼吸道病诊断不清，笼统用药，为避免治疗责任，对各种疾病的混合感染统一认为是禽流感。治疗呼吸道病时，抗病毒药、抗菌药一起用。还有部分养殖场和技术员认为原粉(药)疗效好、价钱便宜，如用碱性原药治疗，鸡的腺胃、肌胃为酸性，碱性药到达鸡的腺胃、肌胃，造成酸碱不平衡，使药效降低甚至失效，其治疗效果没有复方制剂好。
    三、通风不足
    冬季通风和保温是互相矛盾的，鸡舍通风不足，氨气过重不仅引发多种呼吸道病的发生，还会延误治疗。对呼吸道病来说，在良好的环境中结合药物治疗效果较好，但在恶劣的环境中则很难治愈。因此，合理的通风换气，有利于疾病的治疗和痊愈。
    四、病难治愈
    气囊炎、支气管堵塞、肺炎对鸡的危害最大，也最难治愈。鸡呼吸道病还可引发其他疾病，如：新城疫、大肠杆菌病等，如果单一用呼吸道药，会使药效不明显或越来越严重，导致养殖户产生“死马当活马医”或尽快出栏的心理。
    总之，今冬鸡的呼吸道病比以往更明显、更突出、更难治。早诊断、早治疗是关键，合理通风是根本，科学用药是基础。