１、猝倒病。
猝倒病又叫绵腐病、卡脖子。除使幼苗受害外，还能引起果实腐烂。
1.1、症状。种子出土前受害时造成烂籽。出土后，在近地茎基部先呈水渍状，病部随即变黄，缢缩凹陷。子叶还未凋萎，幼苗即已倒地。此病发生很快，常从个别植株开始发病，发展形成成片发病。潮湿时病部可密生白色棉絮状霉。如在子叶下面发病，则称为“卡脖子”现象。
1.2、防治方法。播前用多菌灵和百菌清配制药土，“下铺上盖”作苗床消毒。出苗后也可用此药土围根。防止棚模直接向苗床滴水。发病后，用1：5.5：400的铜铵制剂喷洒株根、床面，同时注意升温降湿，改善苗床环境条件。
２、立枯病（站着死）
2.1、症状。主要发生在育苗的中后期。先在茎基部产生椭圆形的暗褐色病斑，白天萎蔫，夜间恢复。以后病斑绕茎一周，并向下凹陷、干缩，直至植株死亡，育苗中期以后，苗子茎部已经木栓化，所以发病也不倒伏，发病的部位也多无白霉，只有蜘蛛网样的淡褐色霉层，这是它与猝倒病的主要区别。
2.2、防治方法。除采取猝倒病的防治方法外，还可喷洒抗枯灵300倍液，敌克松1000倍液，50%福美双可湿性粉剂500倍液，温室育苗时，晚上和阴天每30m2安装2只40W日光灯，也有补光、增温、防病的作用。
对于上述苗病，播后至出苗连喷3次800—1000倍的高猛酸钾液，效果很好。
３、沤根
3.1、症状。根部不发新根，根皮发黄，呈锈色，最后腐烂，幼苗萎蔫，极易拔起。
3.2、发病原因。主要是低温、高湿和光照不足所致。
3.3、防治方法。人为补光，提高床温，搂划放墒，行间撒草木灰吸潮降湿。
另外，苗期死苗、发生弱苗的原因还可能有二氧化碳中毒、根结线虫危害，以及浇水过多造成的寒根和施化肥不当而造成的肥害烧根。对此，必须对症下药。
4 、病毒病
辣椒病毒病对产量影响较大。早期发生，轻者减产50%—60%；重者可造成绝收，是辣椒生产中主要病害之一。
4.1、为害症状。主要有4种类型，其表现症状各异。
一是坏死型。于现蕾初期发生，嫩尖小叶脱落，有时大量落叶、落花、落果，造成植株光秆。有时用手一摇晃植株，叶、花、果随之脱落。细看顶芽和嫩芽已枯死，茎秆上有坏死的褐色条斑，植株矮小，落叶与正常叶无差异。
二是花叶型。轻型花叶，初期嫩叶上出现黄绿相间的斑驳，植株无矮小、畸形和落叶症状。重型花叶，除具轻型花叶之症状外，叶面还表现为凹凸不平，凸起部分呈泡状，叶片畸形。有时叶变成线形，边缘向上卷曲，植株生长缓慢，矮化，果小。
三是丛枝型。植株矮小，节间变短，叶片狭长，小枝丛生，但不落叶。开花即落，很少结果，或个别结畸形果。
四是花黄型。叶片自下而上逐渐变黄，落叶、落果。
4.2、发病规律。高温干燥、重茬地、缺水缺肥、生长不良、蚜虫多时发病严重。
土壤干燥，突然浇水，或植株感染炭疽病、疮痂病等，都可以引起落叶。某些品种有落叶的毛病，应注意与病毒病引起的落叶相区别。
4.3、防治方法。一是选用抗病毒病的品种和无毒种子。二是种子消毒。种子浸泡后，再用1%的高锰酸钾溶液浸泡30分钟，或3%磷酸三钠浸泡20分钟，用清水冲洗后催芽。可消除种皮带菌。三是实行3年以上轮作。四是培育无毒壮苗。用营养钵育苗，注意苗期防蚜。五是定植后覆地膜，加强管理，促早发根发棵，提高植株抗病力。六是发病初期可用下列药剂防治：高锰酸钾1000倍+磷酸二氢钾200—300倍+食醋100倍+尿素200倍+红糖200倍混合液（10kg水里分别加10g、30—50g、100g、50g和50g），也可用菌毒清300倍液+硫酸锌300倍液，还可用菌毒清300倍液防治。上述药剂7—10天喷1遍，连喷3遍，对防治该病均有一定效果。
5、疮痂病（细菌性斑点病）
5.1、为害症状。主要为害叶、茎，有时也为害果实。叶片发病，出现水渍状黄绿色小斑点，后呈不规则形，边缘隆起，暗褐色，中间凹下，淡褐色，表面粗糙的疮痂状病斑。受害叶的叶缘、叶尖变黄，干枯脱落。若病斑沿叶脉发生，则叶变畸形。茎上病斑木栓化隆起，呈纵裂条样疮痂状。果上病斑初起小黑点，后变为隆起的圆形或长圆形黑色的疮痂状。潮湿时疮痂中间有菌液溢出。
5.2、发病规律。病菌主要在种子上或随病株残体在田间越冬，借灌水或昆虫传播，从气孔侵入。高温高湿、排水不良、窝风及植株生长势差则病害重。
5.3、防治方法。一是种子消毒。用升汞1000倍液浸泡5分钟，用清水洗净，或用1：10链霉素液浸种30分钟。二是与瓜类和十字花科蔬菜实行2—3年以上轮作。三是药剂防治。农用链霉素200mg/kg，医用链霉素（100万单位）1支，对5kg水;或新植霉素200mg/kg，每7—10天喷1次，连喷2—3次。
6、疫病
6.1、症状。茎、叶、果实均可发病。苗期染病幼苗茎基部呈水浸状软腐，致使上部倒伏，病部多呈暗绿色。定植后，叶片发病部位呈暗绿色斑，致使叶片软腐，易脱落。茎或果实染病也产生暗绿色病斑，引起软腐或倒折。湿度大时病部可见白霉，即病原菌。
6.2、发病规律及条件。卵孢子在土壤中越冬。气温适宜，有水滴，病菌可随水滴、土粒等飞溅到寄主上引起发病。此菌在温度10—37℃均能生长发育，适温为30℃.
6.3、防治方法。一是避免与瓜类和茄果类蔬菜连用，可与十字花科、豆科类蔬菜轮作。二是选用无病新土育苗，发现病苗及时拔除。三是加强田间管理，避免高温高湿条件出现。四是发病初期喷洒75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或25%甲霜灵可湿性粉剂600—800倍液，或64%杀毒矾M8可湿性粉剂400—500倍液。每亩用药液40kg，隔7天左右喷1次，视病情连续喷2—3次。病害大流行时间隔期还可缩短，必要时可连续用药2次，以后视天气和病情扩展情况，决定是否再用药。
7、青枯病
青枯病又叫细菌性枯萎病，在我国发生普遍，来势凶猛。结果初期即成片死亡，严重时发病率可达80%—100%。
7.11、症状。从株高30cm左右开始叶片萎蔫下垂，夜间可暂时恢复，以后全株枯死。植株根系发育不良，变褐腐败，近地面茎的维管束也变为褐色，用手挤压有污白色粘液（菌脓）溢出。
7.2、防治方法。一是与粮食作物轮作，避免与茄果、大豆、花生等连作。二是苗床要高燥，播种要适期，采取带土移栽，护根育苗，高畦栽培；增施氮、钾肥，高温时禁用粪稀，病期严禁大水漫灌，用10mg/kg硼酸溶液根外喷施。三是药剂防治。病穴用2%甲醛液或辣椒灵1g，加水6—8kg灌根；植株喷雾用72%农用链霉素4000倍液，或77%可杀得500倍液。
8、绵疫病
绵疫病又叫掉蛋、水烂，发生普遍，蔓延极快。
8.1、症状。可发生于植株各个部位，但以果实最重，而且下部比中上部更重，不管果大果小均可发病。发病初期，果面出现水渍状圆斑，以后逐渐扩大，最后遍及整个果实。病部稍凹陷，呈黄褐色至暗褐色。高湿时，病部产生茂密的白色棉絮状物。内部果肉变黑腐烂。病斑扩展到果面1/2时，果实很易脱落，但幼果却不一定一烂即落。病果不论脱落与否，遇潮湿都会在病斑表面长满白霉，最后干缩为黑褐色僵果。已被病菌侵染而尚未显示症状的果实，采收后即很快腐烂。
8.2、防治方法。一是选用抗病品种。二是高垄栽培，早摘病果，适当摘除病叶，增施有机肥料。三是与豆类蔬菜轮作。四是浇水前后每5—10天喷1次下列药剂：80%代森锌可湿性粉剂500倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或喷洒200倍液硫酸锌+200倍磷酸二氢钾+300倍尿素+400倍植物胞分裂素+300倍DT杀菌剂混合液，随配随喷，不可过夜。地面铺黑色或白色塑料薄膜，提高地温，减少浇水次数。
9、软腐病
9.1、症状。果实初呈暗绿色水渍状病斑，随后果实腐烂发臭，脱落或挂在枝上干枯，后呈白色。
9.2、防治方法。实行地膜覆盖栽培，注意防治害虫，减少伤口。用防治细菌药剂喷洒植株。发现病株、病果及时拔（摘）除，并用石灰、干草木灰对病穴消毒。
10、日浇果
10.1、症状。果实的向阳面发生大片脱色病斑，与周围健部组织界限明显。病斑变干后呈革质状，变薄，组织坏死，以致引起炭疽病及其他腐生菌生长，出现褐色霉层。在湿度大时，则常因细菌侵染而使果实腐烂。
10.2、发生规律。果面曝晒在阳光下，使果实局部过热而造成的生理病害。早晨，果面出现露珠，阳光直射，经水珠聚光作用灼伤果实表面细胞，即为日烧病。土壤缺水时易引起日灼，作物因病毒病、蚜虫及螨类危害，密度过稀等都易发病。柿子椒发病尤重。
10.3、防止对策。合理密植，使果面不受阳光直射，实行南北行向种植，加强肥水管理，使枝叶繁茂，及时防病治虫，都可预防日烧果发生。
11、脐腐病
11.1、症状。发生于脐部，病部变褐，后期染病部位常被杂菌寄生，也可腐烂。
11.2、病因。为生理性病害，多因水分供应失常及缺钙造成。当土壤水分一直充裕，唯植株旺盛生长时骤然缺水，此病当即发生。也有人认为是植株不能从土壤中吸取足够的钙素，致使脐部细胞生理紊乱，失去控制水分能力而发病。
11.3、防治对策。一是地膜覆盖，可保持土壤水分相对稳定，并可减少多次浇水引起钙的淋失。二是进入结果期时，叶面喷洒1%过磷酸钙浸提液，10—15天喷1次，连喷2—3次。
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