不合理的栽培制度对土壤肥力影响很大。在同一块土地上连续栽培同一种蔬菜时，蔬菜生长发育不良，病虫害严重，产量降低，即产生所谓连作障碍。产生连作障碍的原因很多，而土壤传染的病菌增加，土壤理化性质变劣等是主要原因。采取合理的轮作制度，可减轻和防止病虫害的发生。同一地块连续栽培同种或同科蔬菜，因吸收带走的养分种类相同或相似，所以往往造成某种或几种养分的缺乏。土壤养分比例失调，常使钙、镁、硼、钼等元素缺乏。一般情况下，施肥量大时产量较高，蔬菜作物从土壤中带走的养分量就多，土壤肥力消耗也就越快。连作中土壤微生物活性加强，土壤中有机质被微生物迅速分解利用，常发生有机质含量减少，孔隙度下降，土壤缓冲能力降低。因此，对蔬菜合理施肥是保持和提高菜田土壤肥力，减少蔬菜生理障碍的关键，尤其是设施蔬菜栽培中更应注意蔬菜的合理施肥。