一是不要出池后立即施用  沼肥的还原性强，出池后立即施用，会与作物争夺土壤中的氧气，影响种子发芽和根须发育，导致作物叶片发黄、凋萎。因此，沼肥出池后，一般先在储粪中存在5-7天后施用。
  二是不要不兑水直接追施  沼肥不兑水直接施在作物上，尤其是用来追施幼苗，会使作物出现灼伤现象，沼肥作追肥时，要先兑水，一般兑水量为沼液的一半。
  三是不要表土撒施  沼肥施于旱地作物宜采用穴施、沟施，然后盖土，施用于水田应在耙前均匀撒施田面，然后犁翻入底层。
  四是不要过量施用  施用沼肥的量不能太多，一般要比施用普通猪粪肥少。若盲目大量施用，会导致作物徒长，行间荫蔽，造成减产。
  五是不要与草木灰、石灰等碱性肥料混施  草木灰、石灰等碱性较强与沼肥混合，会造成氮肥的损失，降低肥效。