玉米秸秆还田方式较多，一般根据耕种轮作方式不同而不同。常见的有机械粉碎翻压还田方式、玉米秸秆覆盖下茬作物还田方式、免耕秸秆还田方式等。机械粉碎翻压还田方式，一般在收获果穗后立即还田，趁秸秆青绿状态进行，既易粉碎，又能保证质量。一般玉米秸秆还田，田间土壤含水量应在田间持水量的60%-70%，适宜温度在28-35℃范围内。土壤肥力水平较低时，秸秆还田数量不宜多，一般以200-260千克/亩为宜。土壤肥力水平较高时，还田数量可达400-500千克/亩。玉米秸秆还田应配施一定量的其他肥料，尤其是氮肥，如每吨秸秆还田的同时施15-20千克尿素，也可配施适量的有机肥、磷肥、硫肥等。　　 　　 
    玉米秸秆覆盖下茬作物还田虽然还田质量没有收获后立即机械粉碎翻压还田好，但却能很好地解决秸秆问题，节省劳动力，同时起到保温、保肥、抑制杂草的作用。近年不少地方应用玉米免耕秸秆还田，直接将玉米秸秆铺在田块上，免耕种植下茬作物，玉米秸秆经过长期自然腐烂，给土壤补充养分。