斑点叉尾鮰深受市场欢迎，发病率较低，养殖农户越来越多，但斑点叉尾鮰作为无鳞鱼，对部分药物十分敏感，斑点叉尾鮰对四种药物的敏感顺序依次为敌百虫＞硫酸铜＞甲醛＞食盐。敌百虫不宜作为饲养斑点叉尾鮰时全池遍洒的治疗药物。高锰酸钾亦不宜作为斑点叉尾鮰的浸洗药物。虽然斑点叉尾鮰的抵抗力强，疾病少，但管理不善也会导致水霉病、孢子虫病、烂鳃病等发生。尤其是早春，鱼体受伤后易患水霉病，因此操作时应小心谨慎，避免鱼体受伤，并注意预防，同时在选用药物时要慎重，考虑敏感性。