南方水稻黑条矮缩病是由白背飞虱传毒感病的一种水稻病毒病，病毒病防治目前没有好药剂，防控的关键是防治好传毒媒介白背飞虱，通过“治虫防病”来控制病害发生为害。 
    秧田治虫防病是有效防控水稻南方黑条矮缩病的关键。2010年南方水稻黑条矮缩病在我县单季稻、烟后、菜后稻、双晚稻上发生严重。按照省厅《2012年福建省南方水稻黑条矮缩病防控工作方案》要求和清流县的水稻生产状况，从播种开始抓好南方水稻黑条矮缩病各项防控措施的落实。
    一是秧田选择要远离双早稻田；二是播种前采用吡虫啉拌种处理；三是提倡集中连片、统一育秧、旱育秧，有条件的地方提倡用防虫网覆盖育秧；四是高度重视秧田期白背飞虱的防治，要根据灯下飞虱迁入情况和田间虫情，及时喷药防治白背飞虱2～5次，选用吡蚜酮或噻嗪酮等加上速杀性好的敌敌畏或毒死蜱等喷雾防治；五是秧苗移栽前，要施好送嫁药；六是秧苗移栽时，要注意剔除矮小病秧。