在大棚设施条件下空气相对湿度较高，黄瓜易发生病虫害，应采用综合措施防治。 
　　一、农业防治
　　⑴选用抗耐病品种。抗枯萎病的黄瓜品种有津优30号、津优10号，抗病毒病的品种有宁丰4号、中农6号、中农14号等，抗霜霉病的品种有宁丰4号、津优10号等，抗白粉病的品种有津优10号、津优30号等。根据当地病害发生情况选用适宜品种。⑵种子处理。温汤浸种，用55℃温水浸种15分钟或用50℃温水浸种20-30分钟，或者用药剂拌种和种子包衣等方法处理种子。⑶培育壮苗。清除田间枯枝残叶和杂草，采用营养钵育苗，营养土用无病土并闷膜杀虫、杀菌。施用腐熟有机肥，加强苗床管理。选用无病虫壮苗定植。⑷深耕晒垡。深耕晒垡可以将地下害虫和病原菌翻到地表，受到天敌啄食或严寒冻死，降低病虫基数，同时可以使土壤疏松，有利于瓜苗根系发育，提高植株抗逆性。⑸科学施肥。以有机肥为主，适施化肥，增施磷钾肥和各种微肥。施足底肥，勤施追肥，结合喷施叶面肥。⑹嫁接防病。用黑子南瓜苗作砧木嫁接黄瓜苗，控制枯萎病发生。
　　二、物理防治
　　⑴灯光诱杀。用白炽灯、高压汞灯、黑光灯、频振式杀虫灯等诱杀害虫。⑵色板、色膜驱避和诱杀害虫。利用蚜虫、白粉虱、斑潜蝇等对黄色的趋性，在田间悬挂黄色捕虫板黏住蚜虫、白粉虱、斑潜蝇等。⑶太阳能土壤消毒。在夏季高温休闲季节，通过长时间覆盖塑料薄膜来提高土壤温度，以杀死土壤中的害虫和病菌。秋延后大棚黄瓜栽培也适宜采用此法。⑷合理调控温湿度。合理调控棚室内的温湿度，有利于黄瓜生长，提高植株抗病能力。采用覆盖无滴膜、铺地膜、铺稻草、膜下灌水等措施降低棚室内湿度，控制病害发生。采用高温闷棚措施，可以预防黄瓜霜霉病。