菌丝银白，像细羊毛状，毛短整齐，浓密，粗壮有力，齐头并进地延长直至瓶底，生长均匀，上下一致，挖出来成块，不松懈。
　　菌丝长满瓶后，在菌体外表通常会分泌出褐色水珠。以后在瓶壁四周和外表涌现浅黄色透明胶质耳芽。
　　菌种柱与瓶壁紧贴，瓶内壁附有少量白色水珠的为新鲜菌种。若瓶底有浅黄色积水，菌柱离壁干缩，为老化菌种，不能使用。
　　正常的菌种有黑木耳特有的馥郁味道，若有臭味和霉味，或涌现斑块状及球状不发菌的景象，是细菌污染，若有其它红、绿、黄、黑等色，说明已被杂菌污染，也不能使用。
　　培养基与瓶壁之间若涌现浅黑色的胶质物（耳基），说明是早熟或扩接次数过多的菌种，栽培后耳片小，数量多，不易长大，品格差，产量低，应予淘汰。
　　若瓶内能够看到木颗粒而菌丝很少，说明培养时间太短，应延续培养。若培养一段时间后没什么显然变革，说明培养基营养不足，应予弥补。
　　如果菌种长至一半左右或一个角落不再延续生长，可能是太干或太湿之故。若菌丝生长整齐，浓密，突然涌现疏落，并有一显然的分界，说明上部料适中，下部压得过实过密。