1、选择适合于大棚栽培的品种 目前，在生产上可选择金凤凰、金海蜜、金蜜6号等植株生长势强、抗性强的品种。
    2、营养土和种子消毒 （1）营养土消毒。4份充分腐熟的椰糠，加1份河沙均匀混合后配成营养土，用100倍的甲醛充分淋湿混匀盖膜闷制7-10天。（2）种子消毒。淘汰有病虫弱小籽粒，进行种子消毒，减少种子带菌量。方法①用 55-60℃ 温水中浸种搅拌使水冷却到30℃，浸种3小时，将种子取出后用0、1%的高锰酸钾溶液消毒20分钟。②用40％甲醛100倍液，将种子在凉水中预浸5 h，转入甲醛中浸15min，再用清水洗净即可催芽播种。
    3、苗期管理 （1）苗床施肥要适量，施用腐熟的有机肥，播前浇足底水，以提高土壤溶液浓度和床温。（2）播后不浇水或少浇水，防止大水漫灌；要及时通风排湿，增加环境和苗床的蒸发量。（3）子叶出土后，防止徒长苗，适当通风透气，增强光照和降低温度，培育壮苗。（4）坚持每天仔细观察苗情，一旦发现中心病株，立即拔除，并向穴内撒生石灰或药土（70%甲基托布津1份，土50份拌匀）进行局部消毒，防止病菌蔓延。（5）及时检查防治害虫。
    4、药剂防治 首先要检查是生理性病害还是侵染性病害，是侵染性病害的要进一步确定病原，以选择相应的药剂进行防治。(1)猝倒病：用72％ 克露可湿性粉剂1000倍液喷雾或浇灌。(2)立枯病：用50％多菌灵800倍液或70％ 托布津1000倍液喷雾或浇灌。猝倒病和立枯病(3)灰霉病：用40％克霉灵300倍液或75％百菌清800倍液喷雾。（4）炭疽病：用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍喷雾。（5）菌核病：对于菌核病可选用25%粉锈宁可湿性粉剂3000倍液或50%速克灵可湿性粉剂1000倍液喷雾。
    5、生物防治 瓜类苗期病害十分严重，化学药剂防治虽能解决一些问题，但是蔬菜水果类作物不宜加大用药量，且一些化学药剂长期使用后，病原菌容易产生抗药性。立枯病可用5%井岗霉素1000被浇灌苗床。张玉勋（1996）等筛选到生防细菌Psedomonas fluorescens P1菌株对黄瓜苗期猝倒病病害防治效果达26、7％ ，优于多菌灵农药(16、5% ，500x)。对厚皮甜瓜苗期立枯病的防治效果也很好，可使苗子死亡率降低20．5％ ，且明显有刺激生长的作用。