至2006年文山市种子体系改革后，保留种子管理站，工作由以前的经营转入管理，且乡镇农技站也不再经营种子，种子经营推向市场化，文山市的种子市场非常活跃，2013年在文山市辖区内经营种子的企业和经销商近200家，“两杂”品种多达150多种，农民在购买种子时一定要注意以下问题：
    一是到合法的种子经营者处购买种子；二是购买包装、标识符合法规要求的种子；三是了解品种的特征特性和栽培技术要点；四是向售种者索取购种凭证和品种介绍等有关资料；五是播种后将种子包装袋连同购种凭证、品种介绍等资料一起保存，以备发现种子质量问题时作为索赔的依据 。