如果发现肉鸭群有普通传染病，首先应该隔离。隔离后根据具体的传染病进行治疗，同时做好周围环境及其他肉鸭群体的消毒和卫生防疫工作。如果发现鸭群发生传染性极强的重大疫病，应立即上报国家主管部门，按照国家动物重大疫情疫病处理措施进行处理。 
    确认发生重大疫情后，县级以上地方人民政府兽医主管部门应当立即划定疫点、疫区和受威胁区，具体划定标准由国务院兽医主管部门制定。有关人民政府应采取相应的应急控制措施。在重大动物疫情应急处理中，设置临时动物检疫消毒站以及采取隔离、扑杀、销毁、消毒、紧急免疫接种等控制、扑灭措施时，应由有关重大动物疫情应急指挥部决定，有关单位和个人必须服从。拒不服从的，由公安机关协助执行。